Ель обычная (остальные наименования - ель европейская и даже the Christmas Tree, другими словами Рождественское дерево) - всем известное хвойное дерево, которое в России растет от северной границы лесов до южной чернозёмной зоны. В средней полосе России соседствует с сосной обычной и лиственными деревьями, образуя смешанные леса. В Европе же ель обширно всераспространена на северо-востоке, а вот в западных регионах она встречается лишь в горах: в Альпах, Карпатах и горах Балканского полуострова.
Ель владеет рядом увлекательных параметров. Так, она нетребовательна к почвам и различается высочайшей теневыносливостью. Ель имеет свойство давать новейшие побеги-клоны из корней отмерших стволов. Возраст самой старенькой известной ели с учётом клонов добивается 9550 лет. И это не говоря о том, что в индустрии обширно употребляются легкая и мягенькая древесина ели и ее кора. Не считая того, в качестве фармацевтического сырья употребляют шишки: они содержат эфирное масло, смолы, дубильные вещества. Настой почек ели оказывает противомикробное, спазмолитическое и десенсибилизирующее действие - так отвар и настой шишек используют для исцеления болезней дыхательных путей и астмы.
Но, даже принимая во внимание все эти принципиальные и достойные внимания свойства ели, навряд ли ученые могли представить, что геном этого дерева окажется самым большим из всех геномов, которые когда-либо были ранее расшифрованы.
Исследование, результаты которого в ночь на четверг размещены в престижном журнальчике Nature, было проведено ботаническим исследовательским центром в шведском городке Умео (UPSC) и лабораторией науки для жизни в Стокгольме (SciLifeLab). Стоимость проекта составила 70 миллионов шведских крон ($10,6 млн), что значительно меньше стоимости исследования людского генома, составившей 20 млрд крон ($3 миллиардов).
В общей трудности ученые выявили около 29 000 многофункциональных генов, больше чем имеет человек (20 000-25 000 генов по результатам проекта Human Genome Project) и практически столько же, сколько имеет резуховидка Таля (Arabidopsis) - узнаваемый модельный организм, как муха дрозофила, птица зебровая амадина и лабораторная мышь.
Но по своим размерам геном ели превосходит геном человека практически в семь раз, а геном резуховидки Таля - в 100 раз.
В процессе работы исследователи получили ответ на вопросец, почему так происходит. Геном ели содержит такие фрагменты, которые получили условное заглавие «геном ожирения» - эти фрагменты показывают огромное количество повторений последовательностей ДНК, которые накопились в итоге сотен миллионов лет эволюции. У растений и животных есть действенные механизмы по удалению таковых повторов, чем же не могут повытрепываться хвойные.
Наибольшей неувязкой в проекте было получение около 20 млрд «букв» генетического кода в правильном порядке, не запутавшись в повторениях шифра ДНК.
«Представьте для себя библиотеку, в какой содержится 10 000 книжек шириной с Библию, но все эти книжки написаны на языке, в каком есть всего четыре буковкы. И как как будто бы кто-то взял 100 копий с каждой из 10 000 книжек, выслал это в искоренитель документов и перемешал. Опосля таковой процедуры собрать четкие копии каждого заголовка, быть может мало проблематично», - объясняет доктор Стефан Янссон из UPSC.
«Мы обязаны были настроить компы и переписать почти все компьютерные программы, используемые в подобных исследованиях, для того, чтоб совладать с расшифровкой большого количества ДНК последовательностей», - заявил говорит доктор Йоаким Лундберг из SciLifeLab.
Он отметил, что в данной работе из-за огромного размера генома ели был достигнут предел шведской гос системы по хранению данных, и это была только одна из почти всех практических заморочек, которые необходимо было решить, чтоб сохранить проект в работе и достичь его фуррора.
Результатам данной работы шведские ученые, работающие в области сельскохозяйственных наук, лицезреют обширное применение.
«Новейшие и поболее действенные сельскохозяйственные технологии должны быть применены для того, чтоб 200 миллионов саженцев, высаживаемых каждый год, становились посильнее и здоровее, вне зависимости от того, в котором районе они растут: бедном либо богатом питательными веществами, - заявил доктор Уве Нильссон из UPSC. - Лесная индустрия вступает в новейшую эру, и Швеция владеет потенциалом для того, чтоб быть в авангарде».