О этом говорится в статье, размещенной в журнальчике Nature, передает РИА Новости.
«Капсид ВИЧ владеет 2-мя противоречащими друг дружке качествами. Он должен защищать генетический материал от повреждений, но при всем этом он должен быстро раскрываться в тот момент, когда он попадает вовнутрь клеточки. Скорость раскрытия имеет огромное значение - она обязана быть не очень стремительной, не очень медленной. Может быть, что нам получится употреблять данный факт для себя на пользу», - заявил Клаус Шультен (Klaus Schulten) из Иллинойского института в городке Урбана (США).
Шультен и его коллеги получили 1-ое трехмерное изображение капсида ВИЧ с атомным разрешением, проанализировав данные «микротомографии» вируса ВИЧ с помощью суперкомпьютера. Для этого биологи разработали особенный компьютерный метод, который равномерно соединял вместе «кусочки» капсида, информация о структуре которых была уже известна.
Для сотворения большой модели из 64 миллионов атомов потребовался суперкомпьютер Blue Waters с суммарной мощностью в 11,5 петафлопc, разработанный компанией Cray по заказу института Иллинойса и Государственного центра суперкомпьютерных приложений. По словам биологов, структура капсида оказалась на удивление обычный - он представляет собой мозаику из 12 «пятиугольников» и 216 «шестигранников», состоящих из пары молекул 1-го и такого же белка.
Эти элементы способны поменять свою форму в широких пределах, в зависимости от нрава связей с примыкающими фрагментами «мозаики». Проанализировав их структуру, ученые выделили особенные тройные спирали на границе «швов» на поверхности вируса. По их словам, данные участки очень важны для стабильности вирусной частички, что дозволяет применять такие спирали в качестве «мишени» для будущих фармацевтических средств и вакцин.